Ahmed Omar Sheij, hijo de un acaudalado comerciante pakistaní nacido en el Reino Unido, fue detenido y condenado a la pena de muerte en julio del 2002 por el asesinato de Pearl, mientras que otros tres implicados fueron sentenciados a cadena perpetua. Según los investigadores pakistaníes, Ahmed Omar atrajo a Pearl ofreciéndole una entrevista con un clérigo islámico que tenía vínculos con Richard C. Reid, el británico acusado de intentar volar un avión que hacia la ruta entre París y Miami, más conocido como el terrorista del zapato.
Pero en el 2011, el Proyecto Pearl de la Universidad de Georgetown, que investigó el asesinato, afirmó que Sheij y los otros tres reos habían sido condenados erróneamente. Determinó que como miembros del grupo islamista Jaish-e-Muhammad habían estado involucrados en el complot para secuestrar a Pearl, pero no eran responsables de su asesinato.