El Ministerio de Justicia está coordinando con las comunidades autónomas a las que se ha transferido la competencia de medios materiales y humanos de la Administración de Justicia los criterios para que la nueva oficina judicial funcione con un protocolo común. La intención del ministerio, según ha informado el director general de Modernización, José de la Mata, es establecer un protocolo común, tanto para realizar actuaciones como para el desarrollo de las tareas complementarias.
Con este objetivo, el Ministerio de Justicia mantiene contactos con las autonomías que tienen transferida la competencia en esta materia. De la Mata ha explicado que se trata de que cualquier funcionario que tenga una tarea determinada la pueda desempeñar en otra oficina judicial sin problemas, porque «el sistema informático y la forma de actuar serán los mismos».