Aunque inicialmente el nuevo edificio del Ministerio de Fomento estaba proyectado en una parcela próxima a la estación de autobuses, los técnicos se decidieron por otra situada junto a una la vía de entrada a la ciudad más importante: la avenida Alfonso Molina. Con este proyecto, según explica el arquitecto Arturo Franco Taboada, se completaba la serie de edificios singulares que el ministerio ya tiene en la ciudad, como son los de Hacienda, Aduanas, la Delegación del Gobierno y antigua jefatura de Obras Públicas, la Autoridad Portuaria, el edificio de Defensa, el de Correos, así como el Gobierno Civil y antigua subdelegación del Gobierno. El que ahora se levanta «completa esta lista», explica el arquitecto, «aunque con un funcionamiento y un planteamiento totalmente independiente».
El Ministerio de Fomento ha apostado por un diseño que da «la solemnidad y el rigor» que una institución de este tipo precisan. También la calidad de los materiales que se utilizan está entre las mejores del mercado y esa es una de las razones, entre otras, por las que el presupuesto de construcción y de urbanización de la parcela supera los cinco millones de euros. La empresa encargada de ejecutar los trabajos es la UTE (unión temporal de empresas) formada por Vías y Construcciones, S.?A. y por Construcciones Especiales y Dragados.
Los trámites para la realización de este edificio comenzaron en el 2003, durante la gestión de José Manuel Piris como director de la Demarcación de Carreteras del Estado. Entonces se realizaron los primeros proyectos, dándoles continuidad con el actual director de la delegación de Carreteras, Ángel González del Río, y Eduardo Toba Blanco como jefe del servicio de explotación y conservación de la Demarcación. Las actas para el replanteo del proyecto se firmaron el 27 de septiembre del 2006 y el plazo de ejecución de las obras se fijaba para el 28 de mayo del 2008, pero una serie de cambios ralentizaron el proyecto, que, finalmente, se retomó hace un par de meses para poder concluirlo en octubre del próximo año.