En el caso de la Diputación Provincial, al lastre que tendrá que asumir por el sobrecoste del estadio de Pasarón hay que sumarle el desfase presupuestario de la ampliación del Museo, que incrementará en más de un 20% el coste final. En total, el sobrecoste de esta obra supondrá un gasto a mayores de unos tres millones de euros, si bien desde el BNG se apunta a que el al no estar finalizada todavía la obra, el sobrecoste puede suponer finalmente el doble de esa cifra.
A finales del año pasado, representantes del PP y del BNG analizaron con los técnicos las razones del desfase presupuestario. Una primera razón hay que buscarla en que los restos arqueológicos que se hallaron durante la ejecución de la primera fase de la obra se se multiplicaron por quince o por veinte con respecto a las previsiones. Entre esos hallazgos destacaron los de parte de la muralla de la ciudad y de una vieja herrería.
Además, durante la ejecución de los trabajos se decidió modificar la instalación eléctrica para adaptarla a la normativa europea, así como ampliar el número de metros destinados al Museo. Donde estaban previstos almacenes y sótanos, habrá finalmente salas de exposiciones.
Otros cambios significativos de cara al coste final afectaron a la configuración de las estructuras y de las placas. También hubo modificaciones en la fachada que da a la calle Sierra y la obra experimentó un retraso de más de un año como consecuencia de la recuperación de restos acordada con Patrimonio. Este retraso produjo pérdidas a la empresa ya que la obra que se hizo en año y medio podría haberse ejecutado en apenas seis meses de no haber problemas de ese tipo.