Cambio de argumentos
En un primer momento, Grande-Marlaska atribuyó el cese a razones de organización internas y lo desvinculó de ese informe, si bien posteriormente matizó que respondía a la filtración del mismo a los medios y argumentó que no daba más detalles por respeto a la carrera profesional De los Cobos.
El cese también motivó la dimisión del máximo mando operativo de la Guardia Civil, Laurentino Ceña, mientras que Pérez de los Cobos fue destinado a petición propia en comisión de servicios en la Intervención Central de Armas y Explosivos en Madrid, dependiente del general de la Jefatura de Armas, Explosivos y Seguridad. Ahora la sentencia establece que De los Cobos actuó correctamente, «por la legislación aplicable y por las expresas órdenes impartidas» por la magistrada que dirigía la investigación, ya que «estaba sujeto al deber de reserva».